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深圳市疾控中心免疫科主任张世英解释称，深圳17日发生婴儿死亡事件后，之所以晚了两天才上报，是因为“一开始没有想到和乙肝疫苗有关，医院诊断有两个死因，肺部大出血和窒息，18日下午家属索赔时才将疫苗和死亡联系上。19日上午上报后，当天下午就叫停了相关批次疫苗”。
有基层疾控中心工作人员认为，按照国家规定划分的药品安全突发事件分级标准，至迟到12月9日，湖南出现两起疑似疫苗致死事件后，已可构成Ⅱ级（重大）药品安全突发事件，到17日深圳婴儿死亡时，已构成Ⅰ级（特别重大）药品安全突发事件。
有群众据此质疑，相关部门仅简单表态，“预防接种是最基本的公共卫生服务”“疫苗总体来看是安全有效的”，对于部分“疑似问题疫苗”却不公布流向，不告知全国缺口量，而且并未启动应急机制也未解释原因，致使公众疑虑重重。
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“这个（是否属于药品安全突发事件，是否需要预警）属于卫生管理部门的事情，不归疾控部门管。”张世英表示，全国已建立联网的疫苗不良反应监测系统，各医院、产科、防疫站点等都有监测，一旦发生疫苗风险事件就要立刻上报卫生部门。