一项关于自然史的研究提供了关于脊髓性肌萎缩症(SMA)发展的首个临床综述,并将祖先染色体5单倍型和SMN2拷贝数与疾病严重程度联系起来。 SMA是一种破坏性遗传疾病,影响机体控制、运动,进食和呼吸的运动神经元。SMA是全世界婴儿死亡的主要遗传原因,全世界新生儿发病率约为1/10,000,而Mennonite血统婴儿中发病率则高达1/2800。这项观察在群体特异性框架内进行,以阐明疾病表达的细微差异以及随后在生命早期使用的疗法的影响。宾夕法尼亚州斯特拉斯堡的特殊儿童临床医生和研究人员将42名Mennonit族群和14名Amish族群SMA患者纳入研究。该研究今天在PLOS ONE上在线发表。
DNA微卫星和260万标记单核苷酸多态性(SNP)微阵列用于检查单倍型的遗传组成,这一方法揭示了不同患者组之间的结构相似性。Mennonit SMA单倍型(M1a,M2)分别包括1和2个SMN2的拷贝,并且单个Amish SMA单倍型(A1)具有1个SMN2拷贝。 M1a / M1a,M1a / M2和M2 / M2是突出的SMA基因型。
该研究揭示了作为SMN2拷贝数和SMA单倍型的函数的运动神经病变的时间和严重性的重要差异。具有两个SMN2拷贝的基因型与早期疾病发作、运动发育受限有关。然而,更令人惊讶的发现是,与M1 / M1单倍型相比,具有A1 / A1的个体之间临床严重性和存活率的差异,其传递相同数量的SMN2拷贝。研究人员计划使用整个外显子组序列数据以更高的分辨率比较A1和M1a,以便解释这些差异。
原标题:plos one:脊髓肌萎缩与单倍体型之间的关系
资讯出处:Researchers correlate spinal muscular atrophy disease expression with haplotypes
原始出处:Vincent J. Carson et al, Spinal muscular atrophy within Amish and Mennonite populations: Ancestral haplotypes and natural history, PLOS ONE (2018). DOI: 10.1371/journal.pone.0202104