日前,一项刊登在国际杂志Clinical Cancer Research上的研究报告中,来自纽约城市大学的科学家们通过研究解开了科学界长期存在争议的一个问题,即研究人员成功定义了高级别浆液性卵巢癌的分子亚型,这种是一种最常见的卵巢癌形式,也是引发美国女性因癌症死亡的第五大主要原因。
理解常见癌症的分子亚型非常重要,因为临床相似的病例可能在其遗传基础、发病原因和结果上存在一定的差异;研究者Levi Waldron表示,把潜在的不同疾病归类在一起仅仅是它们看起来非常相似,但这却会使得这些疾病的预防和治疗工作变得混乱不堪,这项研究中,研究人员利用特殊的算法就能够帮助流行病学研究和临床研究确定哪些疾病亚型与风险因素、治疗和治疗结果直接相关。
研究者发现,患者的生存状况明显依赖于疾病的分子亚型,预后最差的疾病亚型患者的生存率只有预后最好亚型疾病患者的一半,因此如今我们都知道患者治疗预后的结果与疾病的亚型是密切相关的。如今多个研究小组已经对卵巢癌患者队列机体的肿瘤基因组进行了测序研究,只在区分不同的卵巢癌亚型,每个研究小组都报道了一种定义卵巢癌分子亚型的不同方法。
这项研究中,研究者Waldron及同事通过研究重复了最具影响力的三种亚型分类手段,随后研究人员在单个患者的基因组数据综合性荟萃分析中对三种亚型分类手段进行了对比分析,结果发现,虽然每种分类手段都能将每个肿瘤分配到单个亚型中,但这些算法还能够被改进,从而提高分类的置信水平;随后研究人员通过研究开发出了一种新型的共识分类算法(consensus classifier algorithm),该算法能够有效识别出可以进行自信分类的肿瘤组织,目前研究人员正在通过研究来理解是否剩余的肿瘤存在分类含糊不清的问题,因为这种肿瘤中要么含有多种肿瘤亚型的混合物,要么就是在所有层次上都不确定。
最后研究者Waldron表示,我们希望本文研究结果能够帮助研究人员有效定义卵巢癌的不同分子亚型,从而为不同患者制定个体化疗法提供新的思路和依据。
原始出处:Gregory M. Chen, Lavanya Kannan, Ludwig Geistlinger, et al. Consensus on Molecular Subtypes of High-Grade Serous Ovarian Carcinoma. Clinical Cancer Research (2018). DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-18-0784