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CRISPR筛选技术能找到抵抗黄病毒感染的关键基因

2018-09-21 15:04:47 来源:生物谷

最近,来自西南医学中心的研究人员首次使用CRISPR全基因组筛选手段鉴定出一种有助于细胞抵抗黄病毒感染的基因。黄病毒是一类令人讨厌的病原体,其中包括西尼罗河病毒,登革热,寨卡病毒和黄热病。

在这项发表在《Nature Mircobiology》杂志上的一项研究中,John Schoggins博士领导的研究小组利用CRISPR技术鉴定出IFI6基因是一种靶向黄病毒的强效抗病毒基因。之后,研究人员利用传统的细胞试验证实该基因在防止寨卡病毒,西尼罗河病毒,登革热病毒和黄热病病毒感染方面的作用。

“哺乳动物细胞主要通过分泌干扰素防御病毒感染,干扰素参与机体对这些病毒的先天免疫反应。”作者说道。

Schoggins博士称,他们最近开发的全基因组CRISPR筛选技术能够帮助确定哪种干扰素诱导的基因在抑制黄病毒感染方面发挥了重要作用。“我们对IFI6如何抑制黄病毒进行了相关的表型和机制研究,同时通过CRISPR筛选,使我们能够找到IFI6这一抑制黄病毒感染的因子”,作者说到。

在细胞培养研究中,作者发现IFI6基因表达的蛋白质能够有效抑制肝脏中黄热病的感染,同时能够抑制登革热,寨卡病毒和西尼罗河病毒的感染。研究人员通过在肾脏和皮肤细胞系以及神经元中重复实验证实了上述结果。

对于IFI6蛋白的抗病毒分子机制还有待于未来的工作,作者希望这些知识可以为开发针对黄病毒感染的疗法奠定基础。

资讯出处:CRISPR screen identifies gene that helps cells resist West Nile, Zika viruses

原始出处:R. Blake Richardson, Maikke B. Ohlson, Jennifer L. Eitson, Ashwani Kumar, Matthew B. McDougal, Ian N. Boys, Katrina B. Mar, Pamela C. De La Cruz-Rivera, Connor Douglas, Genevieve Konopka, Chao Xing, John W. Schoggins. A CRISPR screen identifies IFI6 as an ER-resident interferon effector that blocks flavivirus replication. Nature Microbiology, 2018; DOI: 10.1038/s41564-018-0244-1

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