●世界是整体生成的，天地所生的万物，不是杂乱无章的，而是一个有序的整体。因此，关于世界的学问必然是整体的。但是，由于人们认识能力的不足、认识方法的限制，被迫分成了“科学”，也就是“分科之学”。这些分科之学，是从不同角度认识世界的学问，有相应的认识对象、方法、知识体系，似乎是各自独立的专门之学，但是，世界的整体性、生态自然往往被忽略。
●中医学诞生于古代，对于微观世界不太了解，主要从脏腑、皮脉筋骨肉、五官九窍、气血精津液、形神与天地万物的关系进行研究，采用了独特的研究方法，与现代模型方法、模糊集合、控制论、黑箱理论、信息科学、复杂性科学等学术理念基本一致，并且符合执简驭繁的原则。
●中医与西医是不同的学术体系，它们是否能够结合，是不以人们的意志为转移的。只要中医与西医的学术理念逐渐接近，互相接纳，互相补充，就可以逐渐走向结合。通学包容科学、生成包容构成、状态包容形态、多元包容单一、自组织包容他组织等理论，是中西医互相靠近，并逐渐结合的理论基础。
“科学发展观”是我国指导各行各业发展的基本策略，中医药行业也应该贯彻这一方针。但是，由于人们对什么是科学、中医与科学之关系的认识存在分歧，所以笼统地说“科学发展中医”带有很大的模糊性，应该首先分清几个问题，以便由模糊走向清晰。
坚持大科学观，反对科学主义
科学是什么？目前没有一个标准答案，但是，综合各家对“科学”一词的认识，可以说“科学”的基本含义是知识，或者是系统的知识。它还包括人们对于世界的认识方法、勇于探索的精神等，人们日常所说的“科学”一词，是一个很宽泛的概念。科学知识的分类，有自然科学、社会科学、思维科学。因此，科学有广义与狭义的区别，有古今与未来的不同，有简单科学和复杂性科学的差异。
在“科学就是分科之学”的大科学观之中，中医无疑属于科学，并且占有很重要的一席，是横跨自然、社会、思维科学之上，关于人的健康和疾病方面的科学。
“科学主义”是一个狭隘的观点，他们认为只有很少一部分经典物理、化学、数学、天文属于科学，这种科学只产生于欧洲十六世纪之后，其他知识都不属于科学；并且把科学绝对化，认为科学就是正确，是衡量一切的标准，是真理的化身。这是十分有害的观点，科学主义把人们认识世界的知识绝对化，静止地看待科学知识，也就把不断发展的科学当成了宗教和宗教审判，这就违背了科学的本意。“科学主义”表面上推崇科学，实际上借科学打击异己，把科学当成了棍子，把大众愚弄为科学傻子。因此可以看出，“科学主义”不是科学，是打着科学旗号的打手。
不同的科学，都有自己的研究对象，有自己的研究方法，有自己的基本知识。“科学主义”拥有的只是口号、是漫天飞舞的棍子、是愚弄人们的盲目崇拜。
中医是“科学主义”打击的主要对象，在近代坎坷的进程里，中医与国学、汉字一起，成为民族虚无主义打击的“岁寒三友”。
